Exámenes
Este examen parcial supone el
30% de la nota final del curso.
Examen parcial para hacer en casa
Responda a las siguientes preguntas
(10 puntos cada una).
1. ¿Cuál es la estructura
del agua a diferentes temperaturas? ¿Por
qué es importante la estructura del agua en la
formación de estructuras secundarias de proteínas
y en las interacciones proteína-proteína? La
hidratación es importante para mantener soluble
una proteína. ¿De qué modo?
2. Dibuje las estructuras
de 20 L-aminoácidos y 4 nucleótidos. Escriba
sus nombres completos, el código de tres letras
y el código de una letra. Agrupe a los aminoácidos
de acuerdo con la naturaleza de sus cadenas laterales:
hidrofóbicos, hidrofílicos, polares y
no polares. Explique brevemente la tendencia de
cada grupo a interactuar con el agua. Dibuje las
posibles formaciones con enlace de hidrógeno
y explique cómo interactúan con agua. Dibuje
todos los enlaces de hidrógeno posibles para
las bases del ácido nucleico.
3. Describa las características
básicas de las siguientes estructuras secundarias. Asimismo,
explique su función a la hora de determinar las
estructuras de la proteína y los materiales de
proteína.
a. hélice alfa
b. hélice 310
c. hélice p
d. hélice beta
e. lámina beta
f. giros y bucles
g. hélices de colágeno
4. Describa minuciosamente la formación
de los enlaces peptídicos y su estructura. ¿Puede
deducir otras formaciones de estructura basadas en la
estructura del enlace peptídico?
5. ¿Qué es característico
de las hélices arrolladas? Describa hélices
arrolladas de dos, tres y cuatro vueltas. ¿Dónde
se encuentran estos modelos en la naturaleza?
6. Explique la importancia
de la estructura de cristal de alta resolución
del colágeno. ¿Qué hemos aprendido
de la estructura de cristal? Explique por qué
las glicinas y la prolinas son importantes en la formación
de la estructura del colágeno. ¿Cómo
experimentan los colágenos el autoensamblaje?
7. Describa las estructuras
moleculares de la seda del gusano y de la araña. Ambas
proteínas tienen un alto contenido de glicina. ¿Cómo
se disponen estos residuos de glicina en las estructuras
de la seda?
8. Explique brevemente la
herramienta de cristalografía de rayos X utilizada
en la determinación de la estructura molecular
de los materiales biológicos. Explique
también la herramienta de resonancia magnética
nuclear RMN en la determinación de la estructura
molecular de los materiales biológicos.
9. Describa cómo la naturaleza
fabrica varios tipos de biominerales.
10. Sírvase de los
conocimientos adquiridos en clase para diseñar
un motivo estructural de construcción interesante
(sugerencia: utilice varias secuencias de repetición).
X. Alternativa: puede
reemplazar una de las preguntas anteriores (1-9) por
lo siguiente:
Haga una pregunta relacionada
con el material visto en clase que considere que explora
un asunto importante. A continuación, responda
a la pregunta brevemente.
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